Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI) H5N1 HA clade prediction

Home | Determine Clade | Browse Sequence Database | Sample Data
Clade Designation Criteria | View Updates | FAQs | Links | Contact us

Search Segment Database By:
 
Host(s) Continent(s)/Countries Clade(s)
Year From - To
-
Text (e.g., Nigeria)
 

Total Results: 2615 <    1
 A/Anhui/1/2005 2.3.4 DQ371928 Human China 2005
 A/Anhui/1/2005 2.3.4 HM172104 Human China 2005
 A/Anhui/2/2005 2.3.4 DQ371929 Human China 2005
 A/Anhui/2/2005 2.3.4 HM172072 Human China 2005
 A/Anhui/T2/2006 7 EF553329 Human China 2006
 A/avian/Russia/5354-vac/2005 2.2 EU147293 Avian Russia 2005
 A/babbler/Fujian/320/04 6 DQ188905 Avian China 2004
 A/Bangladesh/207095/2008 2.2 FJ573468 Human Bangladesh 2008
 A/bar-headed goose/Mongolia/1/05 2.2 AB233319 Avian Mongolia 2005
 A/bar-headed goose/Mongolia/X25/2009 2.3.2  AB521999 Avian Mongolia 2009
 A/bar-headed goose/Mongolia/X53/2009 2.3.2  AB523767 Avian Mongolia 2009
 A/bar-headed goose/Mongolia/X54/2009 2.3.2  AB523366 Avian Mongolia 2009
 A/bar-headed goose/Qinghai/0510/05 2.2 DQ137873 Avian China 2005
 A/bar-headed goose/Qinghai/1-HVRI/2006 2.2 HM172085 Avian China 2006
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/12/05 2.2 DQ095621 Avian China 2005
 A/bar-headed goose/Qinghai/3/2005 2.2 HM172454 Avian China 2005
 A/bar-headed goose/Qinghai/5/2005 2.2 DQ095617 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/59/05 2.2 DQ095612 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/60/05 2.2 DQ095615 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/61/05 2.2 DQ095618 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/62/05 2.2 DQ095620 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/65/05 2.2 DQ095622 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/67/05 2.2 DQ095623 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/68/05 2.2 DQ095613 Avian China 2005
 A/Bar-headed Goose/Qinghai/75/05 2.2 DQ095619 Avian China 2005
 A/bar-headed goose/Qinghai/F/2006 2.2 DQ822563 Avian China 2006
 A/bar-headed goose/Qinghai/F/2007 2.2 FJ461725 Avian China 2007
 A/bar-headed goose/Tibet/8/2006 2.2 HM172087 Avian China 2006
 A/bean goose/Tyva/10/2009 2.3.2  GQ386150 Avian Russia 2009
 A/Beijing/01/2003 7 EF587277 Human China 2003
 A/bird/Thailand/3.1/2004 1 AY651330 Avian Thailand 2004
 A/black bulbul/Fujian/439/04 6 DQ188906 Avian China 2004
 A/black headed gull/HK/12.1/2003 1 AY651373 Avian Hong Kong 2003
 A/black-crowned night heron/Hong Kong/659/2008 2.3.2  CY036229 Avian Hong Kong 2008
 A/black-headed goose/Qinghai/1/2005 2.2 DQ100554 Avian China 2005
 A/black-headed goose/Qinghai/2/2005 2.2 DQ100555 Avian China 2005
 A/black-headed gull/Qinghai/1/2005 2.2 DQ100556 Avian China 2005
 A/black-headed gull/Qinghai/3/2006 2.2 DQ822564 Avian China 2006
 A/black-headed gull/Tyva/115/2009 2.3.2  GQ338084 Avian Russia 2009
 A/black-necked grebe/Germany/R1393/2007 2.2  AM773724 Avian Germany 2007
 A/blackbird/Hunan/1/2004 6 AY741213 Avian China 2004
 A/blow fly/Kyoto/93/2004 2.5 AB212649 Blow fly Japan 2004
 A/blue magpie/Hong Kong/1993/2007 2.3.4 CY036109 Avian Hong Kong 2007
 A/brown-head gull/Thailand/vsmu-4/2008 1 EU676325 Avian Thailand 2008
 A/Brown-headed Gull/Qinghai/3/05 2.2 DQ095616 Avian China 2005
 A/brown-headed gull/Thailand/VSMU-28-SPK/2005 1 EF178528 Avian Thailand 2005
 A/buzzard/Bavaria/13/2006 2.2 EF165057 Avian Germany 2006
 A/buzzard/Bavaria/5/2006 2.2 EF165049 Avian Germany 2006
 A/buzzard/Denmark/6370/06 2.2 EF523687 Avian Denmark 2006
 A/Canada goose/Bavaria/4/2007 2.2 GU046760 Avian Germany 2007
<    1